조세·관세그룹
[관세] 세관 FTA 원산지 서면조사 세번변경 불충족 판정, 부가가치기준 소명 검토
2026-11-09
세관의 자유무역협정 원산지 서면조사에서 수입 원재료의 세번변경기준(원재료와 완제품의 품목분류 번호가 바뀌어야 원산지를 인정하는 기준)이 불충족되어 특혜관세 배제 통보를 마주한 상황을 다룹니다. 부가가치기준(제품 생산 과정에서 발생한 부가가치 비율로 원산지를 인정하는 기준)으로 원산지 결정기준을 전환하여 제조원가와 자재명세서를 재입증하는 절차를 설명합니다.
한눈에 보기
사건 유형
관세 · 세관 자유무역협정 원산지 서면조사 세번변경 불충족 판정, 부가가치기준 소명(자료를 내어 이유를 밝힘) 검토
관세 · 세관 자유무역협정 원산지 서면조사 세번변경 불충족 판정, 부가가치기준 소명(자료를 내어 이유를 밝힘) 검토
결과를 가르는 것
자유무역협정이 복수의 원산지 결정기준을 인정하고 있는지, 전환하려는 부가가치기준의 공제법(완제품 가격에서 비원산지 재료비를 빼는 방식) 또는 집적법(원산지 재료비와 제조원가를 더하는 방식) 요건을 증빙 서류로 완결성 있게 채울 수 있는지에 따라 판단이 달라집니다.
자유무역협정이 복수의 원산지 결정기준을 인정하고 있는지, 전환하려는 부가가치기준의 공제법(완제품 가격에서 비원산지 재료비를 빼는 방식) 또는 집적법(원산지 재료비와 제조원가를 더하는 방식) 요건을 증빙 서류로 완결성 있게 채울 수 있는지에 따라 판단이 달라집니다.
관련 조문
FTA 관세특례법 제17조
FTA 관세특례법 제17조
이 글의 순서
1 어떤 일로 찾아오시나요?
2 무엇이 문제인가요?
3 어떻게 도와드리나요?
4 결과는 무엇에 따라 달라지나요?
5 비슷한 상황이라면
· 관련 법령
· 자주 묻는 질문
1. 어떤 일로 찾아오시나요?
수출 물품에 대해 자유무역협정(FTA) 원산지증명서를 발급해 왔으나 세관으로부터 원산지 서면조사를 받게 된 제조기업이 있습니다. 조사 과정에서 수입 원재료의 세번변경기준이 충족되지 않는다는 판정을 받고 협정관세 배제 및 세액 추징의 기로에 놓이게 됩니다. 수출 상대국 바이어에게까지 불이익이 번질 수 있는 급박한 상태에서 자문을 구하게 됩니다.
2. 무엇이 문제인가요?
한국과 미국, 한국과 유럽연합 간의 자유무역협정 등 협정관세를 적용받았거나 수출 물품에 대해 원산지증명서를 발급한 기업은 「자유무역협정의 이행을 위한 관세법의 특례에 관한 법률」 제17조에 따라 세관의 원산지 서면조사 또는 현지조사를 받을 수 있습니다. 세번변경기준이나 부가가치기준을 뒷받침하는 자재명세서(부품 목록표), 제조공정도, 원산지소명서, 국내 공급업체의 원산지 확인서 정합성(서류 내용이 서로 빈틈없이 들어맞음)이 입증되지 않으면 협정관세 적용이 배제되거나 수출 상대국 세관에 의해 구매자가 불이익을 겪게 됩니다. 협정별로 다른 결정기준 충족 여부를 원가 계산과 공정 흐름을 통해 다시 소명해야 하는 과제가 발생합니다.
3. 어떻게 도와드리나요?
• 자재명세서(부품 목록표)와 제조공정도, 매입 세금계산서 및 수입신고필증(수입신고가 수리되었음을 증명하는 서류)의 품목번호와 단가를 원점에서 재점검합니다.
• 세번변경기준 충족이 어려울 경우 해당 협정에서 허용하는 부가가치기준 산정 방식을 적용해 협정 체결국 안에서 발생한 부가가치 비율을 다시 계산합니다.
• 재산출된 원가 자료와 원산지소명서를 체계적으로 정리하여 세관의 원산지 검증 질의에 맞춘 소명 서면(이유를 밝히는 문서)을 작성합니다.
4. 결과는 무엇에 따라 달라지나요?
자유무역협정이 복수의 원산지 결정기준을 인정하고 있는지, 전환하려는 부가가치기준의 공제법 또는 집적법 요건을 증빙 서류로 완결성 있게 채울 수 있는지에 따라 판단이 달라집니다. 더불어 기초 자재명세서와 실제 생산 및 회계 전표 사이의 불일치를 얼마나 합리적으로 해명하느냐가 결과를 가릅니다. 다만 사건마다 자료와 사정에 따라 결과는 달라질 수 있습니다.
5. 비슷한 상황이라면
미리 챙겨 두면 좋은 것
• 세관의 서면조사 요구서가 도달하면 회신 기한을 확인하고 기존에 제출했던 원산지 증빙 서류 원본을 즉시 수집해야 합니다.
• 원재료 공급업체로부터 수취한(받은) 원산지확인서와 실제 투입 원자재의 품목번호가 일치하는지 내부 검증을 서둘러야 합니다.
관련 법령
FTA 관세특례법 제17조
한·미 FTA, 한·EU FTA 등 협정관세를 적용받았거나 수출 물품에 대해 원산지증명서를 발급한 기업은 「FTA 관세특례법」 제17조에 따라 세관의 원산지 서면조사 또는 현지조사를 받을 수 있습니다.
한·미 FTA, 한·EU FTA 등 협정관세를 적용받았거나 수출 물품에 대해 원산지증명서를 발급한 기업은 「FTA 관세특례법」 제17조에 따라 세관의 원산지 서면조사 또는 현지조사를 받을 수 있습니다.
자주 묻는 질문
Q. 세관의 원산지 서면조사 요구서를 받으면 어떻게 해야 하나요?
세관의 서면조사 요구서가 도달하면 첫째로 회신 기한을 확인하고 기존에 제출했던 원산지 증빙 서류 원본을 즉시 수집해야 합니다. 둘째로 원재료 공급업체로부터 받은 원산지확인서와 실제 투입 원자재의 품목번호가 일치하는지 내부 검증을 서둘러야 합니다.
Q. 원산지 증빙 서류의 정합성을 입증하지 못할 때 발생하는 불이익은 무엇인가요?
세번변경기준이나 부가가치기준을 뒷받침하는 자재명세서, 제조공정도, 원산지소명서, 국내 공급업체의 원산지(포괄)확인서 정합성이 입증되지 않으면 협정관세 적용이 배제되거나 수출 상대국 세관에 의해 바이어가 불이익을 겪게 됩니다.
Q. 세번변경기준 충족이 어려운 경우에는 어떻게 소명해야 하나요?
세번변경기준 충족이 어려운 경우에는 해당 협정에서 허용하는 부가가치기준 산정 방식을 적용해 역내 부가가치 비율을 다시 계산해야 합니다. 재산출된 원가 자료와 원산지소명서를 체계적으로 정리하여 세관의 원산지 검증 질의에 맞춘 소명 서면을 작성합니다.
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